A | B | C | D | E | F | G | H | CH | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9
Pribnowov box, označovaný i ako Pribnowov-Schallerov box, je sekvencia šiestich nukleotidov, TATAAT, ktorá je nutnou súčasťou promótoru na DNA a značí miesto začiatku transkripcie u baktérií.[1][2][3] Je to idealizovaný konsezuálna sekvencia, čo znamená, že toto sú najčastejšie bázy na daných pozíciách, ale jednotlivé promótory sa môžu líšiť na jednej či viacerých pozíciách. Pribnowov box sa niekedy označuje i ako -10 sekvencia, pretože jeho stred sa nachádza okolo 10 báz pred začiatkom transkripcie.
Úloha Pribnowovho boxu je podobná ako funkcia TATA boxu (zvaného i Hognessov box), ktorý sa nachádza v promótorových sekvenciách u eukaryotov a archeónov – jeho sekvencia je rozpoznávaná RNA polymerázou na začiatku transkripcie.[4] Tento úsek DNA je takisto prvým miestom, kde sa rozplietajú vlákna DNA počas prokaryotickej transkripcie, čím sa umožňuje prístup k templátovému vláknu DNA. Je dôležité, že je táto sekvencia zložená hlavne z adenínu a tymínu, pretože je jednoduchšie prerušiť väzbu medzi nimi než medzi cytozínom a guanínom (kvôli nižšiemu počtu vodíkových väzieb a i slabšiemu stohovaniu jednotlivých báz).[5]
Pribnowov box je pomenovaný po Davidovi Pribnowovi a Heinzovi Schallerovi.[chýba zdroj[1][3]
Sekvencia
Ako je uvedené vyššie, ide o konsenzuálnu sekvenciu, čo znamená, že ide o najpravdepodobnejšie sa vyskytujúce bázy na danej pozícii v sekvencii. Jednotlivé promótory sa však od tejto sekvencie môžu líšiť. Pravdepodobnosť výskytu jednotlivých nukleotidov v Pribnowovom boxe u E. coli je uvedená v nasledujúcej tabuľke:[6]
T | A | T | A | A | T |
---|---|---|---|---|---|
82% | 89% | 52% | 59% | 49% | 89% |
Referencie
- ↑ a b PRIBNOW, David. Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site at an early T7 promoter. PNAS, March 1975, s. 784–788. ISSN 1091-6490. DOI: 10.1073/pnas.72.3.784. PMID 1093168.
- ↑ Transkripcia . Biopedia.sk, . Dostupné online.
- ↑ a b Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site from the DNA of Bacteriophage fd. PNAS, February 1975, s. 737–741. ISSN 1091-6490. DOI: 10.1073/pnas.72.2.737. PMID 1054851.
- ↑ Structural Basis for Promoter −10 Element Recognition by the Bacterial RNA Polymerase σ Subunit. Cell, 2011, s. 1257–69. DOI: 10.1016/j.cell.2011.10.041. PMID 22136875.
- ↑ Base-stacking and base-pairing contributions into thermal stability of the DNA double helix. Nucleic Acids Research, January 2006, s. 564–574. ISSN 0305-1048. DOI: 10.1093/nar/gkj454. PMID 16449200.
- ↑ Analysis of E. coli promoter sequences. Nucleic Acids Research, March 1987, s. 2343–2361. ISSN 0305-1048. DOI: 10.1093/nar/15.5.2343. PMID 3550697.
Pozri aj
Zdroj
Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Pribnow box na anglickej Wikipédii.
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.
Čakanka štrbáková
Český červený králik
Šupina (ryby)
Aerób
Aferentácia
Aktín
Anabióza
Anaerób
Analyzátor (neurológia)
Angelic Organics
Apidológia
Apoptóza
Arachnológia
Asimilácia (biológia)
Australonuphis
Autotrofia
Autotrofný organizmus
Baeolophus
Bahník západoafrický
Baktériová spóra
Balaenoptera
Bazálny metabolizmus
Bentos
Bioblast
Bipédia
Bocian
Botrytis cinerea
Bunkové inklúzie
Calvinov-Bensonov cyklus
Centroméra
Chlamydiae
Chrípka ošípaných
Chromozóm Y
Cyanistes
Dýchací koreň
Dýchací pigment
Džidžitka
Dejiny biológie
Dipterológia
Domestikácia
Dospievanie
Drobnozrnko
Dvorec prsníka
Efektor (fyziológia)
Ekologická kríza
Embryogenéza
Embryológia
Emily LeProust
Endoparazit
Enterocyt
Enterokináza
Epistáza
Etiolizácia
Exkaváty
Exoskelet
Faetony
Fotobiologický jav
Fotoperiodizmus
Fylogenéza
Gastrolit
Genóm
Gonochorizmus
Gorgónia vejárovitá
Gravidita
Histónový kód
Holarktis
Horec bodkovaný
Human Genome Project
Hydrobiológia
Hymenopterológia
Ikra
Incertae sedis
Infrarad
Insekticíd
Interleukín-8
Interleukín 8
Jednobunkový organizmus
Kalcichordáty
Kalcitonín
Katecholamín
Ketóza
Ketóza (metabolizmus)
Kodominancia
Konchológia
Krvotvorba
Lac operón
Leukoplast (organela)
Lichenizmus
Mediátorová ribonukleová kyselina
Mimochod
Minerálna látka (výživa)
Myoblast
Nekódujúca DNA
Nemegtosaurus
Nerv
Neuquensaurus
Neurofyziológia
Neuromodulátor
Nostocales
Nostokotvaré
Nukleoid
Nukleozóm
Onuphis
Oológia
Opaskovce
Oryctolagus
Osmotický potenciál
Osmotický tlak
Otvorený čítací rámec
Parazitický koreň
Parazitizmus
Parus
Petalonema
Planktón
Podkmeň
Podtrieda
Poecile
Pohlavný výber
Poikilotermia
Posttranskripčná úprava
Premenlivosť (biológia)
Pribnowov box
Priebežná rovnováha
Protozoológia
Prsná bradavka
PYLIS sekvencia
Radula
Rast organizmu
Regenerácia
Riin Tammová
RNA-polymeráza
RNA polymeráza
Roztoče
Rudiment
Samica
Schwannova bunka
Sebecký gén
Sericinus montela
Sexuálne vzrušenie
Shigella
Somit
Speciácia
Sporulácia
Sterilizácia (mikrobiológia)
Svalový epitel
Symbiotický koreň
Synúzia
Systémová biológia
Systematika (veda)
Tafonómia
Tektológia
Telofáza
Teoretická biológia
Termoreceptor
Transkripcia (genetika)
Tropomyozín
Troponín
Tuková bunka
Tvár (biológia)
Ušnica
Všežravec
Varroatóza
Vdych
Veľké permské vymieranie
Vibrio
Vyššia nervová činnosť
Vylučovanie (zoológia)
Text je dostupný za podmienok Creative
Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších
podmienok.
Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky
použitia.
www.astronomia.sk | www.biologia.sk | www.botanika.sk | www.dejiny.sk | www.economy.sk | www.elektrotechnika.sk | www.estetika.sk | www.farmakologia.sk | www.filozofia.sk | Fyzika | www.futurologia.sk | www.genetika.sk | www.chemia.sk | www.lingvistika.sk | www.politologia.sk | www.psychologia.sk | www.sexuologia.sk | www.sociologia.sk | www.veda.sk I www.zoologia.sk