A | B | C | D | E | F | G | H | CH | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9
Pribnowov box, označovaný i ako Pribnowov-Schallerov box, je sekvencia šiestich nukleotidov, TATAAT, ktorá je nutnou súčasťou promótoru na DNA a značí miesto začiatku transkripcie u baktérií.[1][2][3] Je to idealizovaný konsezuálna sekvencia, čo znamená, že toto sú najčastejšie bázy na daných pozíciách, ale jednotlivé promótory sa môžu líšiť na jednej či viacerých pozíciách. Pribnowov box sa niekedy označuje i ako -10 sekvencia, pretože jeho stred sa nachádza okolo 10 báz pred začiatkom transkripcie.
Úloha Pribnowovho boxu je podobná ako funkcia TATA boxu (zvaného i Hognessov box), ktorý sa nachádza v promótorových sekvenciách u eukaryotov a archeónov – jeho sekvencia je rozpoznávaná RNA polymerázou na začiatku transkripcie.[4] Tento úsek DNA je takisto prvým miestom, kde sa rozplietajú vlákna DNA počas prokaryotickej transkripcie, čím sa umožňuje prístup k templátovému vláknu DNA. Je dôležité, že je táto sekvencia zložená hlavne z adenínu a tymínu, pretože je jednoduchšie prerušiť väzbu medzi nimi než medzi cytozínom a guanínom (kvôli nižšiemu počtu vodíkových väzieb a i slabšiemu stohovaniu jednotlivých báz).[5]
Pribnowov box je pomenovaný po Davidovi Pribnowovi a Heinzovi Schallerovi.[chýba zdroj[1][3]
Sekvencia
Ako je uvedené vyššie, ide o konsenzuálnu sekvenciu, čo znamená, že ide o najpravdepodobnejšie sa vyskytujúce bázy na danej pozícii v sekvencii. Jednotlivé promótory sa však od tejto sekvencie môžu líšiť. Pravdepodobnosť výskytu jednotlivých nukleotidov v Pribnowovom boxe u E. coli je uvedená v nasledujúcej tabuľke:[6]
T | A | T | A | A | T |
---|---|---|---|---|---|
82% | 89% | 52% | 59% | 49% | 89% |
Referencie
- ↑ a b PRIBNOW, David. Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site at an early T7 promoter. PNAS, March 1975, s. 784–788. ISSN 1091-6490. DOI: 10.1073/pnas.72.3.784. PMID 1093168.
- ↑ Transkripcia . Biopedia.sk, . Dostupné online.
- ↑ a b Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site from the DNA of Bacteriophage fd. PNAS, February 1975, s. 737–741. ISSN 1091-6490. DOI: 10.1073/pnas.72.2.737. PMID 1054851.
- ↑ Structural Basis for Promoter −10 Element Recognition by the Bacterial RNA Polymerase σ Subunit. Cell, 2011, s. 1257–69. DOI: 10.1016/j.cell.2011.10.041. PMID 22136875.
- ↑ Base-stacking and base-pairing contributions into thermal stability of the DNA double helix. Nucleic Acids Research, January 2006, s. 564–574. ISSN 0305-1048. DOI: 10.1093/nar/gkj454. PMID 16449200.
- ↑ Analysis of E. coli promoter sequences. Nucleic Acids Research, March 1987, s. 2343–2361. ISSN 0305-1048. DOI: 10.1093/nar/15.5.2343. PMID 3550697.
Pozri aj
Zdroj
Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Pribnow box na anglickej Wikipédii.
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.
Alotyp (imunológia)
Antigénový drift
Bázový pár
Biofor
Chimérizmus
Chromatín
Dejiny genetiky
Deoxyribonukleová kyselina
Didiploid
Epistáza
Fenotyp
Fylogenetika
Genetická dominanta štruktúry
Text je dostupný za podmienok Creative
Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších
podmienok.
Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky
použitia.
www.astronomia.sk | www.biologia.sk | www.botanika.sk | www.dejiny.sk | www.economy.sk | www.elektrotechnika.sk | www.estetika.sk | www.farmakologia.sk | www.filozofia.sk | Fyzika | www.futurologia.sk | www.genetika.sk | www.chemia.sk | www.lingvistika.sk | www.politologia.sk | www.psychologia.sk | www.sexuologia.sk | www.sociologia.sk | www.veda.sk I www.zoologia.sk