A | B | C | D | E | F | G | H | CH | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9

Kyselina izoasparágová (izoaspartát, izoaspartyl, β-aspartát) je reziduum izomérne s kyselinou asparágovou. Je to β-aminokyselina s posunutou karboxylovou skupinou oproti aspartátu. Izoaspartát nie je samostatnou aminokyselinou, je to len reziduum vystupujúce v proteínoch - vzorcom je ekvivalentná aspartátu, ale v bielkovinách sa viaže γ-karboxylovou skupinou namiesto α-karboxylovej skupiny. Karboxylová skupina bočného reťazca sa teda stáva súčasťou hlavného reťazca peptidu. Táto zmena je spôsobená chemickou reakciou, v ktorej dusíkový atóm nasledujúcej peptidovej väzby nukleofilne atakuje γ-uhlík bočného reťazca asparagínu alebo kyseliny asparágovej (označené čiernou farbou hore na obrázku), čím vzniká sukcínimidový medziprodukt (označený červenou). Hydrolýzou tohto medziproduktu vznikajú dva produkty, buď kyselina asparágová (označená čiernou v ľavej časti obrázka) alebo kyselina izoasparágová, čo je β-aminokyselina (označená zelenou na obrázku dole). V tejto reakcii dochádza i k deamidácii asparagínu. V procese môže dôjsť k racemizácii, čo vedie k tvorbe D-aminokyselín.
Kinetika tvorby izoaspartylu
Reakcie, pri ktorých dochádza k tvorbe izoaspartylu, by mohli byť jedným z faktorov limitujúcich polčas života bielkovín.
Tvorba izoaspartylu prebieha omnoho rýchlejšie, ak v peptidovom reťazci za asparagínom nasleduje malá, flexibilná aminokyselina (napríklad Gly) s odhalenou peptidovou väzbou. Tieto reakcie prebiehajú omnoho rýchlejšie aj pri vyššom pH (>10) a vyšších teplotách.
Oprava
L-Izoaspartylmetyltransferáza opravuje izoasparátové a D-aspartátové reziduá tým, že napojí metylovú skupinu na karboxylovú skupinu bočného reťazca, čím vznikne ester. Ester sa rýchlo a spontánne premení na sukcínimid (označený v obrázku červenou) a náhodne sa premení na kyselinu asparágovú (označenú čiernou) alebo naspäť na izoaspartát (označený zelenou), čo umožní ďalší pokus.
Referencie
- ↑ Propensity for spontaneous succinimide formation from aspartyl and asparaginyl residues in cellular proteins. Int. J., Peptide Protein Res., 1987, s. 808–821. DOI: 10.1111/j.1399-3011.1987.tb03390.x. PMID 3440704.
- ↑ Mass spectrometric analysis of asparagine deamidation and aspartate isomerization in polypeptides. Electrophoresis, 2010, s. 1764–1772. DOI: 10.1002/elps.201000027. PMID 20446295.
- ↑ Succinimide Formation from Aspartyl and Asparaginyl Peptides as a Model for the Spontaneous Degradation of Proteins. J. Biol. Chem., 1989, s. 6164–6170. DOI: 10.1016/S0021-9258(18)83327-0. PMID 2703484.
- ↑ Deficiency in protein L-isoaspartyl methyltransferase results in a fatal progressive epilepsy. J. Neurosci., March 1998, s. 2063–74. DOI: 10.1523/JNEUROSCI.18-06-02063.1998. PMID 9482793.
Zdroj
Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Isoaspartate na anglickej Wikipédii.
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.
2-amino-3-karboxymukonátsemialdehyd
2-aminomukonát-6-semialdehyd
3-hydroxykynurenín
Alanín
Aminokyselina
Arginín
Asparagín
Beta-alanín
Citrulín
Cystín
Cystationín
Cysteín
Dehydroalanín
Diftamid
Esenciálna aminokyselina
Etionín
Fenylalanín
Glukogénna aminokyselina
Glutamát-5-semialdehyd
Glutamín
Glycín
Histidín
Izoleucín
Karnozín
Ketogénna aminokyselina
Kynurenín
Kyselina 2-aminomukónová
Kyselina 3-aminoizobutyrová
Kyselina 3-hydroxyantranilová
Kyselina asparágová
Kyselina cysteínsulfínová
Kyselina cysteová
Kyselina diaminopimelová
Kyselina gama-aminomaslová
Kyselina glutámová
Kyselina hipurová
Kyselina izoasparágová
Kyselina metylhipurová
Kyselina pyroglutámová
L-aspartát-4-semialdehyd
Lantionín
Leucín
Lyzín
Metyllyzín
N'-formylkynurenín
N-formylmetionín
Nikotianamín
Norleucín
Ornitín
Prolín
Proteínogénna aminokyselina
Pyrolyzín
Ramachandranov diagram
S-adenozylhomocysteín
Sacharopín
Selenocysteín
Selenometionín
Taurín
Telurocysteín
Telurometionín
Transaminácia
Tryptofán
Tyrozín
Valín
Text je dostupný za podmienok Creative
Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších
podmienok.
Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky
použitia.
www.astronomia.sk | www.biologia.sk | www.botanika.sk | www.dejiny.sk | www.economy.sk | www.elektrotechnika.sk | www.estetika.sk | www.farmakologia.sk | www.filozofia.sk | Fyzika | www.futurologia.sk | www.genetika.sk | www.chemia.sk | www.lingvistika.sk | www.politologia.sk | www.psychologia.sk | www.sexuologia.sk | www.sociologia.sk | www.veda.sk I www.zoologia.sk
