Sukcinátdehydrogenáza - Biblioteka.sk

Panta Rhei Doprava Zadarmo


A | B | C | D | E | F | G | H | CH | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9

Sukcinátdehydrogenáza
Sukcinátdehydrogenáza (SDH). Katalytická podjednotka SDHA (zelená) obsahujúca molekulu FAD (červená) viaže sukcinát (tmavomodrý). SDHA je spojená s podjednotkou SDHB (svetlomodrá), ktorá obsahuje Fe-S klastre (žlto-oranžové gule). Tento dimér je spojený s hydrofóbnymi podjednotkami SDHC (fialové) a SDHD (žlté), medzi ktorými sa nachádza molekula hemu b (zelenomodrý). Na pomedzí podjednotiek SDHB, SDHC a SDHD sa tiež nachádza väzobné miesto pre ubichinón (červený). Podjednotky SDHC a SDHD sú ukotvené vo fosfolipidovej membráne: vnútornej mitochondriálnej membráne.
Sukcinátdehydrogenáza: zelená periférna podjednotka viaže sukcinát a kovalentne viazaný FAD, modrá periférna jednotka viaže železo-sírové klastry, integrálne podjednotky (ružová a žltá) majú medzi sebou hém, ktorý má štruktúrnu funkciu, nie je redoxne aktívny

Sukcinátdehydrogenáza (tiež Komplex II dýchacieho reťazca, sukcinát:koenzým Q oxidoreduktáza) je enzým citrátového cyklu a dýchacieho reťazca, ktorý oxiduje sukcinát na fumarát:

sukcinát + FADfumarát + FADH2 Δ= 0 kJ/mol

Ide o jediný enzým citrátového cyklu, ktorý je inkorporovný do vnútornej mitochondriálnej membrány. Elektróny získané oxidáciou sukcinátu prenáša sukcinátdehydrogenáza na ubichinón, čo je biogénna organická redoxne aktívna molekula rozpustená v hydrofóbnej fáze vnútornej mitochondriálnej membrány. Primárnym akceptorom elektrónov je koenzým FAD. Sukcinátdehydrogenáza je jediný redoxný enzým citrátového cyklu, ktorý na redoxnú reakciu nevyužíva NAD+.

Štruktúra

Tok elektrónov cez sukcinátdehydrogenázu: sukcinát → FAD → → → → ubichinón

Sukcinátdehydrogenáza bola považovaná za enzým zložený z dvoch rôznych podjednotiek, jedna s molekulovou hmotnosťou 70 kDa a druhá 27 kDa. Dnes sa hovorí o štyroch podjednotkách.

Enzým obsahuje kovalentne viazaný FAD na periférnu podjednotku, ktorá je exponovaná matrixu mitochondrie, a ktorá interaguje so sukcinátom. FAD je vianazý na zvyšok histidínu kovalentnou väzbou na karbocyklus izoaloxazínové tricyklu.

Druhá periférna podjednotka, ktorá je bližšie k membráne, obsahuje tri železo-sírové klastry:

  • S-1: so štardardným redukčným potenciálom E0 = 0 mV, preberá elektróny od FAD,
  • S-2: so štardardným redukčným potenciálom E0 = – 260 mV, preberá elektróny od S-1,
  • S-3: so štardardným redukčným potenciálom E0 = + 600 mV, preberá elektróny od S-2,

Ďalšie dve podjednotky sú integrálne membránové podjednotky, ktoré obsahujú jeden hém, ktorý je uložený medzi dvoma transmembránovými helixami. Úloha hému je nejasná, pre redoxnú aktivitu sukcinátdehydrogenázy je skôr nepodstatná, pretože u Escheria coli tento hém chýba.

V súčasnosti nie je známe, ako je ubichinón redukovaný sukcinátdehydrogenázou na ubichinol. Vie sa, že väzobné miesto pre ubichinón je vzdialené 8 Å od S-3 železo-sírového klastru 3Fe4S.2

Protóny potrebné na protonizáciu redukovaného ubichinónu sú čerpané z matrixu mitochondrií.2 Sukcinátdehydrogenáza nefunguje ako protónová pumpa,2 neprečerpáva protóny z matrixu mitochondrie do medzimembránového priestoru tak, ako to robí kompex I, kompex III a komplex IV dýchacieho reťazca.2

Inhibícia sukcinátdehydrogenázy

upraviť | upraviť zdroj
Malonát, izostér sukcinátu, ktorému chýba jedna metylénová skupina

Sukcinátdehydrogenázu kompetitívne inhibuje:

Prídavok týchto látok spôsobuje hromadenie sukcinátu.4

  1. a b KOOLMAN, Jan; RÖHM, Klaus Heinroch; BENDA, Vladimír. Barevný atlas biochemie. 4. vyd. Praha : Grada Publishing, 2017. ISBN 978-80-247-2977-0.
  2. a b c d e f g h i j k l m NICHOLLS, David G.; FERGUSON, Stuart J.. Bioenergetics 4. 4. vyd. Londýn : Elsevier, 2013. (4.) ISBN 978-0-12-388425-1. (anglický)
  3. a b DOBROTA, Dušan; TURECKÝ, Ladislav; DRGOVÁ, Anna, a kol. Lekárska biochémia. 2. vyd. Martin : Osveta, 2016. ISBN 978-80-8063-444-5.
  4. a b c d Harperova biochemie. Praha : H & H, 2002. (Vyd. v Česku 4., V H & H 3.) Dostupné online. ISBN 80-7319-013-3.
  5. a b BERG, Jeremy M.; TYMOCZKO, John L.; STRYER, Lubert. Biochemistry. 6. vyd. New York : W. H. Freeman and Company, 2007. ISBN 978-0-7167-8724-2.
  6. VOET, Donald. Voet's principles of biochemistry. Hoboken, New Jersey : s.n., 2016. (Global edition.) Dostupné online. ISBN 978-1-119-45166-2.
Zdroj:
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.
Zdroj: Wikipedia.org - čítajte viac o Sukcinátdehydrogenáza





Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok.
Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.

Your browser doesn’t support the object tag.

www.astronomia.sk | www.biologia.sk | www.botanika.sk | www.dejiny.sk | www.economy.sk | www.elektrotechnika.sk | www.estetika.sk | www.farmakologia.sk | www.filozofia.sk | Fyzika | www.futurologia.sk | www.genetika.sk | www.chemia.sk | www.lingvistika.sk | www.politologia.sk | www.psychologia.sk | www.sexuologia.sk | www.sociologia.sk | www.veda.sk I www.zoologia.sk