Biologická systematika

Taxonomické; kategorie
	Doména;
	Nadříše / Superskupina;
	Říše;
	Podříše;
	Nadkmen;
	Kmen / Oddělení;
	Podkmen / Pododdělení;
	Infrakmen;
	Parvkmen;
	Nadtřída;
	Třída;
	Podtřída;
	Infratřída;
	Nadřád;
	Řád;
	Podřád;
	Infrařád;
	Nadčeleď;
	Čeleď;
	Podčeleď;
	Tribus;
	Podtribus;
	Rod;
	Podrod;
	Superdruh (Naddruh);
	Druh;
	Poddruh;
	z • d • e;

Systematika (taxonomie) (z řec. slova systema) vědecky zkoumá druhy a druhovou diverzitu organismů a všechny vztahy mezi nimi. Je součástí biologie. Je nadřazená slovu taxonomie, se kterým se však významově překrývá (taxonomie je teorie a praxe klasifikace organismů podle určitých pravidel do jednotlivých hierarchicky uspořádaných taxonomických kategorií).

Dělení systematiky

Systematika má následující součásti:

biologická nomenklatura – systematické pojmenování druhů organismů i dalších taxonů,
klasifikace – řazení do skupin podle určitých pravidel,
taxonomie sensu stricto – teoretická taxonomie,
- mikrotaxonomie – taxonomie druhů a taxonů nižších kategorií,
- makrotaxonomie – taxonomie vyšších taxonů než druh.

Základní taxonomické kategorie jsou tyto:

říše = regnum
kmen, oddělení = phyllum, divisio
třída = classis
řád = ordo
čeleď = familia
rod = genus
druh = species

Současná podoba systému

Rozdělení všech živých organismů je složité, problematické a nejednotné.

Organismy se obvykle dělí do tří domén^{[pozn. 1]}:

Archaea
Bakterie
Eukaryota

V současné době však již víme, že Eukaryota jsou vnitřní skupinou archeí, takže doména Archaea bez zahrnutí eukaryot je nejspíš parafyletická.

Eukaryota se v současné době zpravidla dělí do několika superskupin, které nejsou vymezeny morfologicky, ale vykazují shodné molekulární znaky:

Amorphea (Amoebozoa – Obazoa) – CruMs – TSAR – Archaeplastida – Cryptista – Haptista – Hemimastigophora

Toto dělení se postupně prosazuje ve znamení pádu tradičních říší, které nevyhovovaly současnému pohledu na reálnou fylogenezi organismů, ale jejich systém je snadno uchopitelný například pro středoškolské učebnice, kde stále přetrvává, jde o tyto taxony: Protozoa (prvoci) — Metazoa (živočichové) — Fungi (houby) — Plantae (rostliny) — Chromista (chromisté)

Poznámky

↑ Přibližně od r. 2010 se mluví (zatím hypoteticky) o čtvrté doméně. Tvoří ji (nebo pozůstatek po ní) skupina jaderně-cytoplazmatických virů s velkou DNA označovaná NCLDV (z anglického nucleocytoplasmic large DNA viruses).^[1]^[2] Existují i studie naznačující, že dosud neznámých domén (s pozůstatky ve formě virů) by mohlo být více.^[3] Tzv. "nebuněčné organismy" se však zpravidla mezi živé organismy neřadí (hypotézy o nových doménách se týkají těch, o kterých se spekuluje jako o možných pozůstatcích archaických skupin bývalých buněčných organismů.

Reference

↑ BOYER, Mickaël; MADOUI, Mohammed-Amine; GIMENEZ, Gregory, Bernard La Scola, Didier Raoult. Phylogenetic and Phyletic Studies of Informational Genes in Genomes Highlight Existence of a 4th Domain of Life Including Giant Viruses. E15530. PLoS One . 2. prosinec 2010 . Svazek 5, čís. 12. Dostupné online. PDF . ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0015530. (anglicky)
↑ COLSON, Philippe; GIMENEZ, Gregory; BOYER, Mickaël, Ghislain Fournous, Didier Raoult. The Giant Cafeteria roenbergensis Virus That Infects a Widespread Marine Phagocytic Protist Is a New Member of the Fourth Domain of Life. E18935. PLoS One . 29. duben 2011 . Svazek 6, čís. 4. Dostupné online. PDF . ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0018935. (anglicky)
↑ WU, Dongying; WU, Martin; HALPERN, Aaron, Douglas B. Rusch, Shibu Yooseph, Marvin Frazier, J. Craig Venter, Jonathan A. Eisen. Stalking the Fourth Domain in Metagenomic Data: Searching for, Discovering, and Interpreting Novel, Deep Branches in Marker Gene Phylogenetic Trees. E18011. PLoS One . 18. březen 2011 . Svazek 6, čís. 3. Dostupné online. PDF . ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0018011. (anglicky)

Externí odkazy

Obrázky, zvuky či videa k tématu biologická systematika na Wikimedia Commons
http://www.biolib.cz/index.php?text=viewtree&id=14772 – Strom rozdělení živých organismů

Zdroj:https://cs.wikipedia.org?pojem=Biologická_systematika
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.

[4] Přibližně od r. 2010 se mluví (zatím hypoteticky) o čtvrté doméně. Tvoří ji (nebo pozůstatek po ní) skupina jaderně-cytoplazmatických virů s velkou DNA označovaná NCLDV (z anglického nucleocytoplasmic large DNA viruses).^[1]^[2] Existují i studie naznačující, že dosud neznámých domén (s pozůstatky ve formě virů) by mohlo být více.^[3] Tzv. "nebuněčné organismy" se však zpravidla mezi živé organismy neřadí (hypotézy o nových doménách se týkají těch, o kterých se spekuluje jako o možných pozůstatcích archaických skupin bývalých buněčných organismů.

[1] BOYER, Mickaël; MADOUI, Mohammed-Amine; GIMENEZ, Gregory, Bernard La Scola, Didier Raoult. Phylogenetic and Phyletic Studies of Informational Genes in Genomes Highlight Existence of a 4th Domain of Life Including Giant Viruses. E15530. PLoS One . 2. prosinec 2010 . Svazek 5, čís. 12. Dostupné online. PDF . ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0015530. (anglicky)

[2] COLSON, Philippe; GIMENEZ, Gregory; BOYER, Mickaël, Ghislain Fournous, Didier Raoult. The Giant Cafeteria roenbergensis Virus That Infects a Widespread Marine Phagocytic Protist Is a New Member of the Fourth Domain of Life. E18935. PLoS One . 29. duben 2011 . Svazek 6, čís. 4. Dostupné online. PDF . ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0018935. (anglicky)

[3] WU, Dongying; WU, Martin; HALPERN, Aaron, Douglas B. Rusch, Shibu Yooseph, Marvin Frazier, J. Craig Venter, Jonathan A. Eisen. Stalking the Fourth Domain in Metagenomic Data: Searching for, Discovering, and Interpreting Novel, Deep Branches in Marker Gene Phylogenetic Trees. E18011. PLoS One . 18. březen 2011 . Svazek 6, čís. 3. Dostupné online. PDF . ISSN 1932-6203. DOI 10.1371/journal.pone.0018011. (anglicky)

[pozn. 1]

[1]

[2]

[3]