Prototyp zinkového prstu

Zinkový prst (z angl. zinc finger) je označenie pre štruktúry bežne sa nachádzajúce pri celom rade bielkovín. Umožňujú predovšetkým väzbu daných bielkovín na DNA (a RNA) a je preto súčasťou celej rady tzv. transkripčných faktorov. Nazýva sa podľa toho, že má tvar zahnutého prstu, pričom vo vnútri sa nachádza väzobné miesto pre zinok koordinačne naviazaný na cysteínový a histidínový zvyšok.^[1]

Výskyt

Prvé zinkové prsty boli objavené v roku 1985 v transkripčnom faktore TFIIIA. Dnes je známe, že je v ľudskom genóme kódovaných viac než 700 proteínov obsahujúcich zinkové prsty, a tak zinc fingers predstavujú druhý najbežnejší štrukturálny motív. Obvykle sa v proteíne vyskytuje viac zinkových prstových domén za sebou, aby bola väzba silnejšia či špecifickejšia.^[2]

Štruktúra

Väzba zinkových prstov na DNA

Klasický zinkový prst sa skladá z jedného alfa-helixu a jedného beta-skladaného listu, ktoré sú usporiadané paralelne (vedľa seba) a vytvárajú medzi sebou väzobné miesto pre zinok. Toto väzobné miesto je ďalej stabilizované hydrofóbnymi aminokyselinami, často tyrozínom, fenylalanínom a leucínom. Zinok umožňuje stabilizáciu celej podjednotky, pretože sa pre toto v redukčnom prostredí cytozólu nehodia disulfidové mostíky.^[2]

Referencie

1. ↑ Oxford dictionary of biochemistry and molecular biology. New York : Oxford university press, 2006. ISBN 0-19-852917-1. (anglický)
2. ↑ ^{a b} ISALAN, Mark. Zinc Fingers, Encyclopedia of Biological Chemistry , Four-Volume Set, 1-4. New York : Oxford university press, 2006. ISBN 0-19-852917-1. (anglický)

Zdroj

Chemický portál Biologický portál

Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Zinkové prsty na českej Wikipédii.