A | B | C | D | E | F | G | H | CH | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9

Izocitrátdehydrogenáza je enzým citrátového cyklu, ktorý katalyzuje oxidáciu izocitrátu na oxalsukcinát s následnou spontánnou dekarboxyláciou oxalsukcinátu na 2-oxoglutarát.[3] Koenzýmom izocitrátdehydrogenázy, ktorý prijíma elektróny od izocitrátu je NAD+.[3] Izocitrátdehydrogenáza je homooktamér: je vytvorená z ôsmich rovnakých podjednotiek.[3] Izocitrátdehydrogenáza je ústredný regulačný enzým citrátového cyklu.[3] Reakcia katalyzovaná izocitrátdehydrogenázou je exergonická: ΔG = – 7,1 kJ/mol.[4]
Sumarána reakcia katalyzovaná izocitrátdehydrogenázou je:
izocitrát + NAD+ → oxalsukcinát + NADH → 2-oxoglutarát + CO2[5]
Existujú tri izoenzýmy izocitrátdehydrogenázy: jeden izoenzým využíva ako akceptor elektrónov NAD+ a nachádza sa v matrixe mitochondrií. Tento izoenzým je súčasťou Krebsovho cyklu a je cez NAD+ napojený na dýchací reťazec.[5] NAD+-dependentná izocitrátdehydrogenáza využíva ako kofaktor ešte manganatý alebo horečnatý dikatión, ktoré sa koordunujú na novovzniknutú oxoskupinu, čím uľahčujú spontánnu dekarboxyláciu oxalsukcinátu.[6] Katalyticky významné sú zvyšky tyrozínu Tyr-160 a lyzínu Lys-230. Ďalšie dva izoenzýmy izocitrátdehydrogenázy využívajú ako akceptor elektrónov NADP+ [6] a nachádzajú sa v cytoplazme a v mitochondriách.[5]
-
oxalsukcinát
Regulácia citrátového cyklu pomocou izocitrátdehydrogenázy
Izocitrátdehydrogenáza je:
- alostericky aktivivaná ADP a NAD+ (signály nedostatku energie v bunke),[3]
- aktivovaná vápenatými iónmi Ca2+[3] (vápenaté ióny sa uvoľňujú zo sarkoplazmatického retikula pri svalovej kontrakcii, sú teda signálom spotreby energie)
- inhibovaná ATP a NADH (signály nedostatku energie v bunke).[3]
Izocitrátdehydrogenáza je miestom, ktoré prepája citrátový cyklus s dýchcím reťazcom (cez NADH a NAD+) a oxidatívnou fosforyláciou (cez ADP a ATP). Pri dostatku energie v bunke je vysoký pomer ATP/ADP a bunka nemá dostatok ADP, aby mohlo dochádzať ku fosforylácii na ATPsyntáze oxidatívnou fosforyláciou. Pri dostatku energie sa tak spotrebuje väčšina ADP a prítomné ATP inhibuje izocitrátdehydrogenázu, čím brzdí citrátový cyklus.[3]
Pri dostatku energie v bunke je analogicky vysoký pomer NADH/NAD+, čoho dôsledkom je, že bunka nemá dostatok NAD+,na priebeh oxidačných reakcií v citrerátovom cykle, čo brzdí citrátový cyklus.[3] Prítomný NADH následne inhibuje izocitrátdehydrogenázu.[3]
Pozri aj
Referencie
- ↑ XU, Xiang; ZHAO, Jingyue; XU, Zhen. Structures of Human Cytosolic NADP-dependent Isocitrate Dehydrogenase Reveal a Novel Self-regulatory Mechanism of Activity. Journal of Biological Chemistry, 2004-08, roč. 279, čís. 32, s. 33946–33957. Dostupné online . DOI: 10.1074/jbc.M404298200. (po anglicky)
- ↑ BANK, RCSB Protein Data. RCSB PDB - 1T0L: Crystal structure of human cytosolic NADP(+)-dependent isocitrate dehydrogenase in complex with NADP, isocitrate, and calcium(2+) . www.rcsb.org, . Dostupné online. (po anglicky)
- ↑ a b c d e f g h i j DOBROTA, Dušan; TURECKÝ, Ladislav; DRGOVÁ, Anna, a kol. Lekárska biochémia. 2. vyd. Martin : Osveta, 2016. ISBN 978-80-8063-444-5.
- ↑ KOOLMAN, Jan; RÖHM, Klaus Heinroch; BENDA, Vladimír. Barevný atlas biochemie. 4. vyd. Praha : Grada Publishing, 2017. ISBN 978-80-247-2977-0.
- ↑ a b c Harperova biochemie. Praha : H & H, 2002. (Vyd. v Česku 4., V H & H 3.) Dostupné online. ISBN 80-7319-013-3.
- ↑ a b VOET, Donald. Voet's principles of biochemistry. Hoboken, New Jersey : , 2016. (Global edition.) Dostupné online. ISBN 978-1-119-45166-2.
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.
Antropológia
Aplikované vedy
Bibliometria
Dejiny vedy
Encyklopédie
Filozofia vedy
Forenzné vedy
Humanitné vedy
Knižničná veda
Kryogenika
Kryptológia
Kulturológia
Literárna veda
Medzidisciplinárne oblasti
Metódy kvantitatívnej analýzy
Metavedy
Metodika
Text je dostupný za podmienok Creative
Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších
podmienok.
Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky
použitia.
www.astronomia.sk | www.biologia.sk | www.botanika.sk | www.dejiny.sk | www.economy.sk | www.elektrotechnika.sk | www.estetika.sk | www.farmakologia.sk | www.filozofia.sk | Fyzika | www.futurologia.sk | www.genetika.sk | www.chemia.sk | www.lingvistika.sk | www.politologia.sk | www.psychologia.sk | www.sexuologia.sk | www.sociologia.sk | www.veda.sk I www.zoologia.sk
