Gemmatimonas aurantiaca

Gemmatimonadetes
Vědecká klasifikace
Doména	bakterie (Bacteria);
Kmen	Gemmatimonadetes (nově Gemmatimonadota); Zhang a kol. 2003
třídy
	Gemmatimonadetes (Zhang a kol., 2003) Longimicrobia (Pascual a kol. 2016)
	Některá data mohou pocházet z datové položky.

Bakteriální kmen Gemmatimonadetes (podle nového názvosloví Gemmatimonadota^[1]^[2]) byl formálně ustaven v roce 2003. Do současné doby obsahuje pouze pět popsaných druhů a dělí se do 2 tříd: Gemmatimonadetes a Longimicrobia. Jeho zástupci jsou aerobní a semiaerobní heterotrofní organismy. Gemmatimonadetes jsou relativně běžnou složkou půdních mikrobiálních společenstev, kde tvoří 1-2% přítomných bakterií. Nacházíme je ovšem také ve sladkých vodách, čistírnách odpadních vod a sedimentech.

Popsané druhy

První druh kmene Gemmatimonadetes bakterie Gemmatimonas aurantiaca T-27^T byla popsána roku 2003. Tato gramnegativní, tyčinkovitá a aerobní bakterie byla kultivován z aktivovaného kalu čističky odpadních vod.^[3] Druhým popsaným druhem byla roku 2013 bakterie Gemmatirosa kalamazoonensis KBS708, která byla izolována z organicky obdělávané půdy v Michiganu v USA.^[4]

Dalším popsaným druhem byla Gemmatimonas phototrophica AP64^T, která byla roku 2014 izolována z mělkého sladkovodního jezera Tiān é hú nacházejícím se v čínské provincii Vnitřní Mongolsko^[5]. Unikátní vlastností tohoto organismu je přítomnost fotosyntetických reakčních center. Tento organismus pravděpodobně získal své fotosyntetické geny horizontálním přenosem z fototrofních Proteobakterií. G. phototrophica je fakultativní fotoheterotrof. Pro svůj růst potřebuje přísun organických látek, ale je schopen pokrýt velkou část svých metabolických potřeb pomocí světelné energie.^[6]

Bakterie Longimicrobium terrae CB-286315T byla izolována ze vzorku lesní půdy poblíž španělské Granady. Vzhledem ke své značné fylogenetické odlišnosti ustavila roku 2016 i novou třídu nazvanou Longimicrobia.^[7] Posledním kultivovaným zástupcem Gemmatimonadetes je Roseisolibacter agri AW1220^T izolovaný ze zemědělské půdy v Namibii.^[8]

Reference

↑ OREN, Aharon; GARRITY, George M. Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 2021-10-20 . Roč. 71, čís. 10. DOI 10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987. (anglicky)
↑ LPSN. Domain Bacteria. Dostupné online (anglicky)
↑ Zhang H, Sekiguchi Y, Hanada S, Hugenholtz P, Kim H, Kamagata Y, Nakamura K. Gemmatimonas aurantiaca gen. nov., sp. nov., a gram-negative, aerobic, polyphosphate-accumulating micro-organism, the first cultured representative of the new bacterial phylum Gemmatimonadetes phyl. nov.. Int J Syst Evol Microbiol. 2003, roč. 53, čís. Pt 4, s. 1155–63. Dostupné v archivu pořízeném dne 2008-06-07. Archivováno 7. 6. 2008 na Wayback Machine.
↑ DeBruyn J.M.; Fawaz M.N.; Peacock, A.D.; Dunlap J.R.; Nixon L.T.; Cooper K.E.; Radosevich M. Gemmatirosa kalamazoonesis gen. nov., sp. nov., a member of the rarelycultivated bacterial phylum Gemmatimonadetes.. J Gen Appl Microbiol. 2013, roč. 59, s. 305–312.
↑ Zeng Y.; Selyanin V.; Lukeš M.; Dean J.; Kaftan D.; Feng F.; Koblížek M. Characterization of the microaerophilic, bacteriochlorophyll a-containing bacterium Gemmatimonas phototrophica sp. nov., and emended descriptions of the genus Gemmatimonas and Gemmatimonas aurantiaca.. Int J Syst Evol Microbiol. 2015, roč. 65, s. 2410–2419.
↑ Zeng Y.; Feng F.; Medová H.; Dean J.; Koblížek M. Functional type 2 photosynthetic reaction centers found in the rare bacterial phylum Gemmatimonadetes.. Proc Natl Acad Sci USA. 2014, roč. 111, s. 7795–7800.
↑ Pascual J.; García-López M.; Bills G.F.; Genilloud O. Longimicrobium terrae gen. nov., sp. nov., a novel oligotrophic bacterium of the underrepresented phylum Gemmatimonadetes isolated through a system of miniaturized diffusion chambers.. Int J Syst Evol Microbiol. 2016, roč. 66, s. 1976–1985.
↑ PASCUAL, J., Foesel B.U., Geppert A., Huber K.J., Boedeker C., Luckner M., Wanner G., Overmann J. Roseisolibacter agri gen. nov., sp. nov., a novel slow-growing member of the under-represented phylum Gemmatimonadetes. Int J Syst Evol Microbiol. 2018, roč. 68, s. 1028–1036.

Externí odkazy

Obrázky, zvuky či videa k tématu Gemmatimonadetes na Wikimedia Commons
Taxonomie na taxonomiconu Archivováno 29. 9. 2007 na Wayback Machine.

Pahýl

Tento článek je příliš stručný nebo postrádá důležité informace.
Pomozte Wikipedii tím, že jej vhodně rozšíříte. Nevkládejte však bez oprávnění cizí texty.

Zdroj:https://cs.wikipedia.org?pojem=Gemmatimonas_aurantiaca
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.

[Oren_2021a-1] OREN, Aharon; GARRITY, George M. Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 2021-10-20 . Roč. 71, čís. 10. DOI 10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987. (anglicky)

[2] LPSN. Domain Bacteria. Dostupné online (anglicky)

[3] Zhang H, Sekiguchi Y, Hanada S, Hugenholtz P, Kim H, Kamagata Y, Nakamura K. Gemmatimonas aurantiaca gen. nov., sp. nov., a gram-negative, aerobic, polyphosphate-accumulating micro-organism, the first cultured representative of the new bacterial phylum Gemmatimonadetes phyl. nov.. Int J Syst Evol Microbiol. 2003, roč. 53, čís. Pt 4, s. 1155–63. Dostupné v archivu pořízeném dne 2008-06-07. Archivováno 7. 6. 2008 na Wayback Machine.

[4] DeBruyn J.M.; Fawaz M.N.; Peacock, A.D.; Dunlap J.R.; Nixon L.T.; Cooper K.E.; Radosevich M. Gemmatirosa kalamazoonesis gen. nov., sp. nov., a member of the rarelycultivated bacterial phylum Gemmatimonadetes.. J Gen Appl Microbiol. 2013, roč. 59, s. 305–312.

[5] Zeng Y.; Selyanin V.; Lukeš M.; Dean J.; Kaftan D.; Feng F.; Koblížek M. Characterization of the microaerophilic, bacteriochlorophyll a-containing bacterium Gemmatimonas phototrophica sp. nov., and emended descriptions of the genus Gemmatimonas and Gemmatimonas aurantiaca.. Int J Syst Evol Microbiol. 2015, roč. 65, s. 2410–2419.

[6] Zeng Y.; Feng F.; Medová H.; Dean J.; Koblížek M. Functional type 2 photosynthetic reaction centers found in the rare bacterial phylum Gemmatimonadetes.. Proc Natl Acad Sci USA. 2014, roč. 111, s. 7795–7800.

[7] Pascual J.; García-López M.; Bills G.F.; Genilloud O. Longimicrobium terrae gen. nov., sp. nov., a novel oligotrophic bacterium of the underrepresented phylum Gemmatimonadetes isolated through a system of miniaturized diffusion chambers.. Int J Syst Evol Microbiol. 2016, roč. 66, s. 1976–1985.

[8] PASCUAL, J., Foesel B.U., Geppert A., Huber K.J., Boedeker C., Luckner M., Wanner G., Overmann J. Roseisolibacter agri gen. nov., sp. nov., a novel slow-growing member of the under-represented phylum Gemmatimonadetes. Int J Syst Evol Microbiol. 2018, roč. 68, s. 1028–1036.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Gemmatimonadetes

Vědecká klasifikace
Doména	bakterie (Bacteria)
Kmen	Gemmatimonadetes (nově Gemmatimonadota) Zhang a kol. 2003
třídy
Gemmatimonadetes (Zhang a kol., 2003) Longimicrobia (Pascual a kol. 2016)
Některá data mohou pocházet z datové položky.