File:Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg

Súbor:Phylogenetic tree of coronaviruses.jpg

Nie je dostupné vyššie rozlíšenie.

Phylogenetic_tree_of_coronaviruses.jpg ‎(571 × 451 pixelov, veľkosť súboru: 75 KB, MIME typ: image/jpeg)

Tento zdieľaný súbor je z Wikimedia Commons a je možné ho používať na iných projektoch. Nižšie sú zobrazené informácie z popisnej stránky súboru.

Zhrnutie

PopisPhylogenetic tree of coronaviruses.jpg	English: Phylogenetic analysis of RNA-dependent RNA polymerases (Pol) of coronaviruses with complete genome sequences available. The tree was constructed by the neighbor-joining method and rooted using Breda virus polyprotein. Bootstrap values were calculated from 1000 trees. 1118 amino acid positions in Pol were included. The scale bar indicates the estimated number of substitutions per 20 amino acids. All abbreviations for the coronaviruses were the same as those in Figure 1.
Dátum	24. augusta 2010
Zdroj	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3185738/
Autor	Patrick C. Y. Woo, Yi Huang, Susanna K. P. Lau, and Kwok-Yung Yuen

Licencovanie

Tento súbor podlieha Creative Commons Attribution 3.0 Unported licencii

Môžete slobodne:

zdieľať – kopírovať, šíriť a prenášať dielo
meniť ho – upravovať dielo

Za nasledovných podmienok:

uvedenie autorov – Musíte spomenúť autorov (jednotlivo alebo kolektívne), poskytnúť odkaz na licenciu a uviesť, či ste niečo zmenili. Môžete to urobiť ľubovoľným primeraným spôsobom, ale nie spôsobom naznačujúcim, že poskytovateľ licencie podporuje vás alebo vaše použitie diela.

História súboru

Po kliknutí na dátum/čas uvidíte ako súbor vyzeral vtedy.

	Dátum/Čas	Náhľad	Rozmery	Používateľ	Komentár
aktuálna	02:42, 7. marec 2020		571 × 451 (75 KB)	Guest2625	Uploaded a work by Patrick C. Y. Woo, Yi Huang, Susanna K. P. Lau, and Kwok-Yung Yuen from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3185738/ with UploadWizard

Použitie súboru

Žiadne stránky neobsahujú odkazy na tento súbor.

Globálne využitie súborov

Nasledovné ďalšie wiki používajú tento súbor:

Použitie na bn.wikipedia.org
- করোনাভাইরাস
Použitie na en.wikipedia.org
- Coronavirus
Použitie na fa.wikipedia.org
- کروناویروس
Použitie na fr.wikipedia.org
- Coronavirus
Použitie na ig.wikipedia.org
- Nje Korona
Použitie na sq.wikipedia.org
- Koronavirusi
Použitie na su.wikipedia.org
- Koronavirus

Metadáta

Tento súbor obsahuje ďalšie informácie, pravdepodobne pochádzajúce z digitálneho fotoaparátu či skenera, ktorý ho vytvoril alebo digitalizoval. Ak bol súbor zmenený, niektoré podrobnosti sa nemusia plne zhodovať so zmeneným súborom.

Názov obrázka	The drastic increase in the number of coronaviruses discovered and coronavirus genomes being sequenced have given us an unprecedented opportunity to perform genomics and bioinformatics analysis on this family of viruses. Coronaviruses possess the largest genomes (26.4 to 31.7 kb) among all known RNA viruses, with G + C contents varying from 32% to 43%. Variable numbers of small ORFs are present between the various conserved genes (ORF1ab, spike, envelope, membrane and nucleocapsid) and downstream to nucleocapsid gene in different coronavirus lineages. Phylogenetically, three genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus and Gammacoronavirus, with Betacoronavirus consisting of subgroups A, B, C and D, exist. A fourth genus, Deltacoronavirus, which includes bulbul coronavirus HKU11, thrush coronavirus HKU12 and munia coronavirus HKU13, is emerging. Molecular clock analysis using various gene loci revealed that the time of most recent common ancestor of human/civet SARS related coronavirus to be 1999-2002, with estimated substitution rate of 4´10-4 to 2´10-2 substitutions per site per year. Recombination in coronaviruses was most notable between different strains of murine hepatitis virus (MHV), between different strains of infectious bronchitis virus, between MHV and bovine coronavirus, between feline coronavirus (FCoV) type I and canine coronavirus generating FCoV type II, and between the three genotypes of human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1). Codon usage bias in coronaviruses were observed, with HCoV-HKU1 showing the most extreme bias, and cytosine deamination and selection of CpG suppressed clones are the two major independent biological forces that shape such codon usage bias in coronaviruses.
Autor	Patrick C. Y. Woo
Krátky názov	Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis
Komentár súboru JPEG	The drastic increase in the number of coronaviruses discovered and coronavirus genomes being sequenced have given us an unprecedented opportunity to perform genomics and bioinformatics analysis on this family of viruses. Coronaviruses possess the largest genomes (26.4 to 31.7 kb) among all known RNA viruses, with G + C contents varying from 32% to 43%. Variable numbers of small ORFs are present between the various conserved genes (ORF1ab, spike, envelope, membrane and nucleocapsid) and downstream to nucleocapsid gene in different coronavirus lineages. Phylogenetically, three genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus and Gammacoronavirus, with Betacoronavirus consisting of subgroups A, B, C and D, exist. A fourth genus, Deltacoronavirus, which includes bulbul coronavirus HKU11, thrush coronavirus HKU12 and munia coronavirus HKU13, is emerging. Molecular clock analysis using various gene loci revealed that the time of most recent common ancestor of human/civet SARS related coronavirus to be 1999-2002, with estimated substitution rate of 4´10-4 to 2´10-2 substitutions per site per year. Recombination in coronaviruses was most notable between different strains of murine hepatitis virus (MHV), between different strains of infectious bronchitis virus, between MHV and bovine coronavirus, between feline coronavirus (FCoV) type I and canine coronavirus generating FCoV type II, and between the three genotypes of human coronavirus HKU1 (HCoV-HKU1). Codon usage bias in coronaviruses were observed, with HCoV-HKU1 showing the most extreme bias, and cytosine deamination and selection of CpG suppressed clones are the two major independent biological forces that shape such codon usage bias in coronaviruses.
Kľúčové slová	coronavirus genome bioinformatics

Zdroj:
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.

Zhrnutie

Licencovanie

Štítky

Položky prezentované týmto súborom

motív

Fylogenetický strom ^čeština

stav autorských práv

dílo chráněné autorským právem ^čeština

licencia

CC BY 3.0

dátum vzniku

24. august 2010

MIME

image/jpeg

História súboru

Použitie súboru

Globálne využitie súborov

Metadáta

Zhrnutie

Licencovanie

Štítky

Položky prezentované týmto súborom

motív

Fylogenetický strom čeština

stav autorských práv

dílo chráněné autorským právem čeština

licencia

CC BY 3.0

dátum vzniku

24. august 2010

MIME

image/jpeg

História súboru

Použitie súboru

Globálne využitie súborov

Metadáta

Fylogenetický strom ^čeština

dílo chráněné autorským právem ^čeština