Izocitrátdehydrogenáza - Biblioteka.sk

Panta Rhei Doprava Zadarmo


A | B | C | D | E | F | G | H | CH | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9

Izocitrátdehydrogenáza
Ľudská NADP-dependentná cytozolická iizocitrátdehydrogenáza[1][2]

Izocitrátdehydrogenáza je enzým citrátového cyklu, ktorý katalyzuje oxidáciu izocitrátu na oxalsukcinát s následnou spontánnou dekarboxyláciou oxalsukcinátu na 2-oxoglutarát.[3] Koenzýmom izocitrátdehydrogenázy, ktorý prijíma elektróny od izocitrátu je NAD+.[3] Izocitrátdehydrogenáza je homooktamér: je vytvorená z ôsmich rovnakých podjednotiek.[3] Izocitrátdehydrogenáza je ústredný regulačný enzým citrátového cyklu.[3] Reakcia katalyzovaná izocitrátdehydrogenázou je exergonická: ΔG = – 7,1 kJ/mol.[4]

Sumarána reakcia katalyzovaná izocitrátdehydrogenázou je:

izocitrát + NAD+ → oxalsukcinát + NADH → 2-oxoglutarát + CO2[5]

Existujú tri izoenzýmy izocitrátdehydrogenázy: jeden izoenzým využíva ako akceptor elektrónov NAD+ a nachádza sa v matrixe mitochondrií. Tento izoenzým je súčasťou Krebsovho cyklu a je cez NAD+ napojený na dýchací reťazec.[5] NAD+-dependentná izocitrátdehydrogenáza využíva ako kofaktor ešte manganatý alebo horečnatý dikatión, ktoré sa koordunujú na novovzniknutú oxoskupinu, čím uľahčujú spontánnu dekarboxyláciu oxalsukcinátu.[6] Katalyticky významné sú zvyšky tyrozínu Tyr-160 a lyzínu Lys-230. Ďalšie dva izoenzýmy izocitrátdehydrogenázy využívajú ako akceptor elektrónov NADP+ [6] a nachádzajú sa v cytoplazme a v mitochondriách.[5]

Regulácia citrátového cyklu pomocou izocitrátdehydrogenázy

Izocitrátdehydrogenáza je:

  • alostericky aktivivaná ADP a NAD+ (signály nedostatku energie v bunke),[3]
  • aktivovaná vápenatými iónmi Ca2+[3] (vápenaté ióny sa uvoľňujú zo sarkoplazmatického retikula pri svalovej kontrakcii, sú teda signálom spotreby energie)
  • inhibovaná ATP a NADH (signály nedostatku energie v bunke).[3]

Izocitrátdehydrogenáza je miestom, ktoré prepája citrátový cyklus s dýchcím reťazcom (cez NADH a NAD+) a oxidatívnou fosforyláciou (cez ADP a ATP). Pri dostatku energie v bunke je vysoký pomer ATP/ADP a bunka nemá dostatok ADP, aby mohlo dochádzať ku fosforylácii na ATPsyntáze oxidatívnou fosforyláciou. Pri dostatku energie sa tak spotrebuje väčšina ADP a prítomné ATP inhibuje izocitrátdehydrogenázu, čím brzdí citrátový cyklus.[3]

Pri dostatku energie v bunke je analogicky vysoký pomer NADH/NAD+, čoho dôsledkom je, že bunka nemá dostatok NAD+,na priebeh oxidačných reakcií v citrerátovom cykle, čo brzdí citrátový cyklus.[3] Prítomný NADH následne inhibuje izocitrátdehydrogenázu.[3]

Pozri aj

Referencie

  1. ↑ XU, Xiang; ZHAO, Jingyue; XU, Zhen. Structures of Human Cytosolic NADP-dependent Isocitrate Dehydrogenase Reveal a Novel Self-regulatory Mechanism of Activity. Journal of Biological Chemistry, 2004-08, roč. 279, čís. 32, s. 33946–33957. Dostupné online . DOI: 10.1074/jbc.M404298200. (po anglicky)
  2. ↑ BANK, RCSB Protein Data. RCSB PDB - 1T0L: Crystal structure of human cytosolic NADP(+)-dependent isocitrate dehydrogenase in complex with NADP, isocitrate, and calcium(2+) . www.rcsb.org, . Dostupné online. (po anglicky)
  3. ↑ a b c d e f g h i j DOBROTA, Dušan; TURECKÝ, Ladislav; DRGOVÁ, Anna, a kol. Lekárska biochémia. 2. vyd. Martin : Osveta, 2016. ISBN 978-80-8063-444-5.
  4. ↑ KOOLMAN, Jan; RÖHM, Klaus Heinroch; BENDA, Vladimír. Barevný atlas biochemie. 4. vyd. Praha : Grada Publishing, 2017. ISBN 978-80-247-2977-0.
  5. ↑ a b c Harperova biochemie. Praha : H & H, 2002. (Vyd. v Česku 4., V H & H 3.) Dostupné online. ISBN 80-7319-013-3.
  6. ↑ a b VOET, Donald. Voet's principles of biochemistry. Hoboken, New Jersey : , 2016. (Global edition.) Dostupné online. ISBN 978-1-119-45166-2.
Zdroj:
Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok. Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.
Zdroj: Wikipedia.org - čítajte viac o Izocitrátdehydrogenáza





Text je dostupný za podmienok Creative Commons Attribution/Share-Alike License 3.0 Unported; prípadne za ďalších podmienok.
Podrobnejšie informácie nájdete na stránke Podmienky použitia.

Your browser doesn’t support the object tag.

www.astronomia.sk | www.biologia.sk | www.botanika.sk | www.dejiny.sk | www.economy.sk | www.elektrotechnika.sk | www.estetika.sk | www.farmakologia.sk | www.filozofia.sk | Fyzika | www.futurologia.sk | www.genetika.sk | www.chemia.sk | www.lingvistika.sk | www.politologia.sk | www.psychologia.sk | www.sexuologia.sk | www.sociologia.sk | www.veda.sk I www.zoologia.sk